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LIMS de Genómica y Genética para Laboratorios de Secuenciación NGS

LIMS de genómica para laboratorios NGS. Gestione bibliotecas, secuenciación y demultiplexación con trazabilidad documentada y controles configurados según los requisitos aplicables al alcance del laboratorio.
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LIMS de NGS configurado según estados de muestra, biblioteca, secuenciación y análisis

Interfaz de corrida de secuenciación mostrando parámetros de NovaSeq 6000 y métricas de QC a nivel de carril
Rastree parámetros de corrida, detalles del instrumento y métricas de rendimiento por carril.
Resultados de demultiplexación mostrando rendimientos de muestras, puntajes Q30 y estado de aprobado/fallido entre corridas
Monitoree resultados de demultiplexación con métricas de rendimiento y calidad a nivel de muestra.
Interfaz de conjunto de índices mostrando IDT90 con 96 secuencias de índices duales y sus propiedades
Administre bibliotecas de índices y prevenga choques con rastreo completo de secuencias.
Lista de seguimiento de muestras con tipo de espécimen, concentración y estado en un LIMS de genómica
Realice un seguimiento de cada muestra desde la recepción hasta la secuenciación, con visibilidad completa del estado por proyecto.
Registros de preparación de bibliotecas con protocolo, conjunto de índices, molaridad y estado de control de calidad
Registre los detalles de preparación, asigne conjuntos de índices y confirme el control de calidad antes de la agrupación.

Genómica: logística, análisis y gestión de resultados, control de calidad, inventario y estadística conectados

Entidades genómicas fundamentales

Muestras y tipos de muestras
Extracciones de ADN/ARN
Preparación de bibliotecas
Mediciones de control de calidad de bibliotecas
Asignaciones de índices
Bibliotecas agrupadas
Cuantificación de agrupaciones
Lotes de cebadores y sondas
Ejecuciones de secuenciación
Asignaciones de carriles
Estructuras de lectura
Muestras demultiplexadas
Seguimiento de archivos Fastq
Valores de Ct
Ejecuciones de procesos de análisis
Mapas de placas
Puntos de control de calidad
Proyectos y estudios
Entregables para clientes
Seguimiento de lotes de reactivos
Lotes de amplificación
Conjuntos de índices y códigos de barras
Ensayos de PCR y qPCR
Metrología de secuenciación
Resultados de controles
Ubicaciones de almacenamiento

Capacidades de integración

Sistemas Illumina NovaSeq.
Plataformas Illumina NextSeq.
Metrología Illumina MiSeq.
Oxford Nanopore MinION.
Oxford Nanopore PromethION.
Sistemas de cuantificación qPCR.
Inventario y operaciones en Odoo con Bioanalyzer.
Importación de datos TapeStation
Estaciones de pipeteo automatizado
Resultados del Fragment Analyzer
Mediciones del fluorímetro Qubit
Lectores de placas
Termocicladores
Canales de LIMS a bioinformática
Generación de hojas de muestras
Sistemas de extracción de ácidos nucleicos
Importación CSV demux automatizada
Inventario y operaciones en Odoo BaseSpace
Conexiones API personalizadas
Sistemas de automatización de laboratorios
Escáneres de códigos de barras
Metrología de PCR en tiempo real

Cumplimiento y trazabilidad

Apoyo a requisitos aplicables de ISO/IEC 17025
Requisitos del organismo de acreditación aplicable, cuando correspondan al alcance del laboratorio
Registros configurados para apoyar el alcance acreditado del laboratorio, cuando corresponda
Requisitos EMA (México)
Normas OAA (Argentina)
Historiales de cambios atribuibles y con fecha y hora
Cadena de custodia
Linaje de muestras
Control de versiones
Controles de acceso de usuarios
Permisos basados en roles
Firmas electrónicas
Calibración de instrumentos
Mantenimiento de equipos
Validación de métodos
Procedimientos operativos estándar
Registros de liberación de lotes de reactivos
Gestión de calidad
Control del trabajo no conforme y seguimiento de no conformidades relacionadas
Acciones correctivas
Informes reglamentarios
Integridad de datos
Gestión de documentos
Registros de formación
Registros de verificación de métodos

Estos elementos cubren lo que configura la mayoría de los laboratorios moleculares y de secuenciación. Todo lo específico de sus ensayos, plataformas o alcance de acreditación se añade durante la configuración.

Características Clave del LIMS de Genética y Genómica para Laboratorios NGS

Funcionalidades específicas que abordan la complejidad única de los flujos de trabajo genómicos, desde la prevención de conflictos de índices hasta el cumplimiento normativo.

Trazabilidad documentada de las muestras

Registre el linaje desde el espécimen original hasta la entrega de datos mediante los eventos y documentos definidos en el flujo configurado.

Evite costosos conflictos de índices

La validación integrada detecta posibles colisiones de índices antes de crear el pool, protegiendo corridas de secuenciación costosas de un fallo.

Inventario y operaciones en Odoo y Conectividad

Sincroniza con Illumina, Oxford Nanopore e instrumentos de QC, así como con SAP, Microsoft Dynamics, JD Edwards, Oracle, Salesforce y otras plataformas mediante integraciones con alcance, mapeo, validación y tratamiento de excepciones definidos durante la implantación.

Generación automatizada de hojas de muestras

Consolide los puntos de QC, desde biblioteca y pool hasta valores de Ct, en un sistema con criterios configurables de aprobación y rechazo.

Gestión centralizada del control de calidad

Consolide todos los puntos de QC (biblioteca, pool y métricas de corrida) en un sistema con criterios configurables de aprobación/rechazo.

Apoyo a requisitos aplicables de ISO/IEC 17025

Los historiales de cambios atribuibles, las firmas electrónicas y la documentación controlada pueden apoyar los requisitos que el laboratorio determine como aplicables. Su suficiencia debe verificarse dentro del sistema de gestión y de la implantación validada.

Odoo

Sistema de gestión de laboratorios genómicos basado en Odoo

LIMS.Science funciona íntegramente con Odoo, un potente sistema ERP en el que confían más de 15 millones de usuarios en todo el mundo.

Lo hemos adaptado específicamente para los laboratorios de secuenciación de última generación. Podrá gestionar todo, desde el seguimiento de muestras y la preparación de bibliotecas hasta las secuenciaciones, la demultiplexación y el cumplimiento normativo, en un solo lugar.

  • Configure protocolos NGS, conjuntos de índices y umbrales de QC para sus flujos de trabajo.
  • Seguimiento documentado desde la preparación de la biblioteca hasta la demultiplexación mediante los eventos definidos en el flujo.
  • Aprobación o rechazo de resultados con historial atribuible de revisión del control de calidad, validación de corridas e indicadores definidos.
  • Control de acceso por rol: técnicos, bioinformáticos, gerentes de QC y clientes ven solo lo relevante.
  • Centralice operaciones multi-sitio de investigación o comerciales en un solo panel de control.
  • Acceda desde cualquier lugar a través de la nube o instálelo en su propio servidor seguro.

¿Necesitas ayuda?

Preguntas frecuentes

El LIMS puede apoyar historiales de cambios atribuibles, firmas electrónicas, registros de calibración, validación de métodos, cadena de custodia y flujos de calidad. El laboratorio debe determinar qué norma y requisitos son aplicables a su actividad y alcance; el LIMS no confiere acreditación ni conformidad por sí mismo.

Sí. Admitimos la integración con plataformas Illumina (NovaSeq, NextSeq, MiSeq), sistemas Oxford Nanopore e instrumentos comunes de control de calidad, incluidos Bioanalyzer, TapeStation, sistemas qPCR y Qubit. El sistema se puede configurar para adaptarse a su flota de instrumentos específica y a los requisitos de su flujo de trabajo.

El sistema valida la compatibilidad de los índices al crear bibliotecas agrupadas, comprobando posibles conflictos basándose en sus conjuntos de índices y la química de secuenciación. Puede mantener bibliotecas completas de combinaciones con doble índice con validación automática para proteger las costosas secuenciaciones de fallos por colisión de índices.

Sí. Durante la implantación se configuran los estados de muestra, extracción, biblioteca, agrupación, corrida y análisis, junto con las funciones, puntos de control de calidad, excepciones y aprobaciones. Las interfaces con secuenciadores, equipos de control de calidad o canalizaciones bioinformáticas se definen por instrumento, formato, mapeo y ruta de fallo.
El sistema maneja diversos tipos de muestras (tejidos, sangre, saliva, muestras ambientales) y aplicaciones de secuenciación, incluyendo secuenciación del genoma completo (WGS), secuenciación del exoma completo (WES), secuenciación de ARN, paneles específicos, metagenómica y secuenciación de células individuales. Los flujos de trabajo se pueden personalizar para operaciones de secuenciación con fines de investigación, clínicos y comerciales.
Puede importar los resultados de la demultiplexación mediante la carga de archivos CSV o integrarlos directamente en su canalización bioinformática. El sistema vincula las muestras demultiplexadas con sus bibliotecas de origen y sus secuencias, lo que garantiza una trazabilidad documentada desde la recepción de las muestras hasta la entrega final de los datos.

Optimice sus Operaciones NGS con un LIMS de Genómica Especializado

Vea cómo nuestro LIMS optimiza sus flujos de trabajo NGS desde el seguimiento de muestras hasta la entrega de datos. Solicite una demostración personalizada para sus operaciones.

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